超聲波粉碎機是利用超聲波在液體中的分散效應，使液體產生空化的作用，從而使液體中的固體顆粒或細胞組織破碎。廣泛應用于生物化學、微生物學、藥物化學、表面化學、物理學、動物學、農學、醫學、制藥等領域。
超聲波粉碎機常規使用方法是把要破碎的材料放到燒杯中，開電源設定時間，將超聲波細胞粉碎機的探頭放到材料中。使用過程中，超聲波發生器電路將50/60Hz的市電轉換成18-21KHz的高頻高壓電能，因此破碎過程中會大量產熱，一般在冰浴下破碎。
1、超聲波粉碎機的超聲探頭插入水的深度在1.5cm左右，液面高度在30mm以上，探頭要居中，不可以貼壁。超聲波是垂直縱波，插入太深不容易形成對流，會直接影響破碎效率。
2、切記空超。這一點很重要。超聲波細胞粉碎機空超的時間越長，對儀器的傷害越大。
3、為了預防冰浴融化后液面下降導致空載，樣品需放在1.5ml的EP管里切記要將EP管固定好。
4、超聲波粉碎機的超聲參數設置：設置鍵好儀器工作參數，對于對溫度要求比較敏感的樣品(比如細菌)一般外面采用冰浴，實際溫度肯定是低于25度，蛋白核酸肯定不會變性。
a、時間：超聲時間每次不要超過5秒，間隙時間應大于或等于超聲時間，以便于熱量散發。時間設定應以超聲時間短，超聲次數多原則，可延長超聲機子以及探頭的壽命。
b、超聲波粉碎機的超聲功率：不宜太大，以免樣品飛濺或起泡沫，如小于10ml樣品容量，功率應在200W以內，選用2mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿選擇開關打到相應擋;10-200ml樣品容量的功率在200-400W，選用6mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿打到相應擋;200ml以上的樣品容量功率在300-600W之間，選用10mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿打到相應擋(2mm的小探頭功率嚴禁超過350W)。
c、超聲波粉碎機的容器：有多少樣品就選多大的燒杯，這樣有利樣品在超聲中對流，提高破碎效率。例如20mL的處理量用20mL的燒杯。
5、超聲波粉碎機的保養方法：使用完后用酒精擦洗探頭或用清水進行超聲清洗。
6、超聲波粉碎機使用前要將超聲變幅桿插入樣品后才能開機，不可以空載操作。
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